More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2003 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  100 
 
 
335 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  88.32 
 
 
335 aa  607  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  75.23 
 
 
336 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  70.75 
 
 
336 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  71.08 
 
 
336 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  74.32 
 
 
337 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  71.39 
 
 
336 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  63.55 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  66.67 
 
 
328 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  58.73 
 
 
332 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.39 
 
 
334 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  56.06 
 
 
333 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  57.27 
 
 
334 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.49 
 
 
331 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  58.66 
 
 
328 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.33 
 
 
332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  58.36 
 
 
328 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  55.29 
 
 
332 aa  358  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  57.58 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 
332 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  59.45 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  55.79 
 
 
328 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.82 
 
 
338 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  55.79 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.18 
 
 
332 aa  351  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  57.45 
 
 
333 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  53.8 
 
 
389 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.08 
 
 
333 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  52.57 
 
 
335 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.71 
 
 
332 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
327 aa  348  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.31 
 
 
332 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.59 
 
 
332 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 
332 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.16 
 
 
334 aa  346  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.89 
 
 
334 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  55.32 
 
 
341 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.62 
 
 
334 aa  345  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.89 
 
 
334 aa  345  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  52.73 
 
 
336 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.73 
 
 
336 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  52.73 
 
 
336 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  55.59 
 
 
334 aa  342  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  53.47 
 
 
333 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
335 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  54.35 
 
 
353 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.57 
 
 
342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.29 
 
 
334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.08 
 
 
334 aa  338  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  55.65 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.63 
 
 
326 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  55.18 
 
 
325 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.82 
 
 
338 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  51.51 
 
 
332 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  53.27 
 
 
338 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.83 
 
 
338 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  52.57 
 
 
334 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.68 
 
 
338 aa  328  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0064  alcohol dehydrogenase  54.19 
 
 
333 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.07 
 
 
323 aa  325  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.23 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  51.53 
 
 
325 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.66 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.66 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.66 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.66 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.66 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.66 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  49.7 
 
 
332 aa  318  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.52 
 
 
339 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.52 
 
 
339 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 
339 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 
339 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.23 
 
 
322 aa  317  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.25 
 
 
332 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1295  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  52.37 
 
 
360 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0519873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.39 
 
 
332 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0128  quinone oxidoreductase putative, PIG3  55.26 
 
 
331 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180561  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.89 
 
 
334 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.63 
 
 
339 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  52.07 
 
 
339 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  51.07 
 
 
332 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.59 
 
 
334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  54.88 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
345 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
345 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  50.3 
 
 
328 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.85 
 
 
356 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
344 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  50 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.95 
 
 
369 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  48.04 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.29 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.78 
 
 
326 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0640  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.4 
 
 
332 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0541  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
332 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.31 
 
 
320 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>