More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3539 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
321 aa  630  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  58.18 
 
 
321 aa  374  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.43 
 
 
321 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  60.19 
 
 
322 aa  364  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1225  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.49 
 
 
322 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0982  alcohol dehydrogenase  60.62 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.56 
 
 
322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  56.6 
 
 
320 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  56.6 
 
 
319 aa  352  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  59.32 
 
 
325 aa  346  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3750  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 
326 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.68 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  56.74 
 
 
334 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7575  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.94 
 
 
313 aa  328  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.98 
 
 
320 aa  325  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  58.82 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  55.62 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0607  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.5 
 
 
319 aa  311  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1267  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.99 
 
 
322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.370033  normal  0.178282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.66 
 
 
319 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  48.34 
 
 
330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2114  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.16 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.828454  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4074  alcohol dehydrogenase  52.34 
 
 
320 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3694  alcohol dehydrogenase  52.2 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 
339 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 
345 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
347 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.85 
 
 
342 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
342 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.85 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
334 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
329 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.25 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.25 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
329 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
339 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.02 
 
 
341 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.03 
 
 
329 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
344 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.21 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.6 
 
 
350 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
342 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.03 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
341 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
340 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.49 
 
 
346 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.18 
 
 
359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
361 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.14 
 
 
340 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.75 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
331 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.91 
 
 
341 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
338 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
342 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.4 
 
 
341 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.84 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.12 
 
 
340 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  30.65 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 
340 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
340 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
342 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.09 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 
340 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 
360 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
340 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
340 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.95 
 
 
340 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.36 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.88 
 
 
342 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.88 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
336 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
358 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35 
 
 
352 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
337 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.75 
 
 
336 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
336 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
336 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
337 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
337 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  29.5 
 
 
336 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.28 
 
 
335 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.68 
 
 
342 aa  101  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.69 
 
 
333 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.54 
 
 
335 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.36 
 
 
339 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.24 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1312  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.11 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.303987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>