More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2505 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.37 
 
 
336 aa  341  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.04 
 
 
338 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 
336 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.42 
 
 
332 aa  325  9e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.04 
 
 
336 aa  325  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.7 
 
 
338 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  51.84 
 
 
337 aa  315  8e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  47.89 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
335 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.89 
 
 
336 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  49.39 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  49.41 
 
 
337 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.41 
 
 
337 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  48.06 
 
 
336 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
337 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  49.21 
 
 
336 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  47.76 
 
 
336 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.76 
 
 
336 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
337 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.09 
 
 
335 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.09 
 
 
378 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.09 
 
 
335 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.09 
 
 
335 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.09 
 
 
335 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 
335 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.09 
 
 
405 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
339 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.93 
 
 
388 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.09 
 
 
405 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.53 
 
 
335 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.71 
 
 
337 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.34 
 
 
335 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 
337 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  43.9 
 
 
353 aa  259  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
341 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  45.61 
 
 
335 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
336 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.35 
 
 
339 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  44.48 
 
 
347 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.52 
 
 
339 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 
333 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 
339 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
338 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.56 
 
 
332 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.23 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
339 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.9 
 
 
342 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
367 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
336 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.85 
 
 
336 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.6 
 
 
337 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.6 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
340 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
352 aa  205  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.39 
 
 
359 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
341 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.54 
 
 
342 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.07 
 
 
320 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.24 
 
 
342 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.93 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
342 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  38.49 
 
 
312 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  35.1 
 
 
365 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.07 
 
 
339 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
342 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  39.44 
 
 
358 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
341 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.55 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.55 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.55 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.81 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.83 
 
 
329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
331 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.96 
 
 
329 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
338 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 
347 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.79 
 
 
331 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.38 
 
 
332 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.63 
 
 
341 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  32.38 
 
 
332 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.17 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
339 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
332 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
345 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
337 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>