More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2233 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
352 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.39 
 
 
336 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.35 
 
 
338 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  46.71 
 
 
336 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  45.07 
 
 
336 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.51 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.99 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  45.21 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.67 
 
 
332 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  45.62 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.94 
 
 
338 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  44.74 
 
 
339 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 
336 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.25 
 
 
334 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
337 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.04 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  42.6 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  42.18 
 
 
336 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
335 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  43.16 
 
 
339 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
341 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.32 
 
 
336 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
336 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.1 
 
 
335 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.63 
 
 
335 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 
339 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
339 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.06 
 
 
336 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
336 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
336 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  40.95 
 
 
335 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
337 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40 
 
 
337 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  41.19 
 
 
335 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
341 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  37.39 
 
 
347 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.27 
 
 
405 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.27 
 
 
405 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.27 
 
 
378 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.27 
 
 
335 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.27 
 
 
335 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.67 
 
 
336 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.27 
 
 
335 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.27 
 
 
335 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.56 
 
 
320 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.76 
 
 
388 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  34.8 
 
 
336 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 
338 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.44 
 
 
334 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  36.76 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.27 
 
 
337 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
335 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.56 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
367 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.68 
 
 
336 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.2 
 
 
343 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  33.43 
 
 
365 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.97 
 
 
342 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 
339 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 
312 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.06 
 
 
359 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.52 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  31.16 
 
 
332 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
332 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
344 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
329 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.25 
 
 
327 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
339 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.25 
 
 
326 aa  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.04 
 
 
338 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.88 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.61 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2020  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 
339 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 
332 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
325 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3096  putative NADPH quinone oxidoreductase  33.74 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.751832  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2150  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.06 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.94 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.57 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 
335 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
332 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.38 
 
 
335 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
339 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.07 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>