More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0980 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.6 
 
 
337 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  53.29 
 
 
333 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  52.77 
 
 
367 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.94 
 
 
340 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.87 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.12 
 
 
342 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
332 aa  265  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 
337 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
338 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  39.94 
 
 
353 aa  250  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.34 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.34 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.34 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.34 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.34 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.34 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  44.34 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.34 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
335 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
339 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  43.49 
 
 
337 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.2 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.77 
 
 
339 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  44.89 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  43.33 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  43.27 
 
 
339 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.55 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 
335 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 
335 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.12 
 
 
336 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  43.54 
 
 
335 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
336 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  43.12 
 
 
336 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
336 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 
335 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.49 
 
 
337 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 
336 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.64 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.22 
 
 
338 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 
339 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.63 
 
 
339 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  42.02 
 
 
336 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  42.73 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
339 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.41 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.34 
 
 
337 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  43.4 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.42 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.41 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  37.21 
 
 
347 aa  199  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 
337 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 
335 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
343 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.35 
 
 
338 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.07 
 
 
336 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.28 
 
 
339 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.24 
 
 
352 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.89 
 
 
320 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  32.74 
 
 
365 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  35.06 
 
 
331 aa  155  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.32 
 
 
359 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
324 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
324 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.76 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.21 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.21 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.21 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.61 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.07 
 
 
324 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  34.22 
 
 
312 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  34.28 
 
 
341 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.92 
 
 
342 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.66 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  34.23 
 
 
332 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
324 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
337 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.62 
 
 
342 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
329 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.3 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.53 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
324 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.94 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
342 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
332 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
347 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.44 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.61 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>