More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1079 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 324 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  99.07 
 
 		 324 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  80.56 
 
 		 324 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  79.01 
 
 		 324 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  79.94 
 
 		 324 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  80.56 
 
 		 324 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  81.1 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  80.25 
 
 		 324 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  78.7 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  69.25 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.23 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.11 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.11 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  61.18 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.92 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  59.32 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 		 326 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.89 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  57.76 
 
 		 324 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  54.66 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  54.04 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.11 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.94 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  52.62 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.63 
 
 		 325 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  57.89 
 
 		 324 aa  330  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.2 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.11 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  53.11 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.7 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  52.48 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.7 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.06 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  48.34 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.58 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.34 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.03 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  46.89 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 		 332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.14 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  44 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  43.51 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.53 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 		 326 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.54 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  44.72 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  46.71 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.61 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.39 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.36 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  43.18 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  45.16 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  42.81 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.12 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.6 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  43.14 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.69 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.24 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2450  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.99 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.82 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>