More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1153 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  97.62 
 
 
336 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
336 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  76.65 
 
 
336 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  76.65 
 
 
336 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  75.45 
 
 
336 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  75.45 
 
 
336 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.95 
 
 
335 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.35 
 
 
336 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  67.56 
 
 
336 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  72.21 
 
 
339 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.05 
 
 
337 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.27 
 
 
405 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.27 
 
 
335 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.27 
 
 
335 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.27 
 
 
378 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.27 
 
 
335 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.27 
 
 
405 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.27 
 
 
335 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.31 
 
 
388 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
335 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  62.05 
 
 
335 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  61.45 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  60.84 
 
 
335 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60 
 
 
335 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  60.65 
 
 
335 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  60.97 
 
 
337 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  61.94 
 
 
335 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.19 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 
337 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.14 
 
 
338 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
332 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.09 
 
 
338 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
337 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.32 
 
 
332 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
337 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  41.42 
 
 
339 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  42.6 
 
 
347 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.1 
 
 
339 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  40.78 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.34 
 
 
337 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.55 
 
 
337 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.77 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
333 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.55 
 
 
337 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.58 
 
 
338 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 
367 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  36.61 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
339 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.56 
 
 
343 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.74 
 
 
334 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  39.39 
 
 
312 aa  180  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.67 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  38.08 
 
 
358 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.13 
 
 
339 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  33.63 
 
 
365 aa  170  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.77 
 
 
336 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.21 
 
 
342 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.92 
 
 
342 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.66 
 
 
341 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.59 
 
 
341 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.52 
 
 
359 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
342 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.99 
 
 
329 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.28 
 
 
329 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.7 
 
 
329 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.41 
 
 
329 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
329 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
340 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
342 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.79 
 
 
342 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.39 
 
 
329 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.39 
 
 
329 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
329 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.39 
 
 
329 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.94 
 
 
332 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.85 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
329 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.45 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
342 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
329 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
332 aa  139  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
331 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  33.84 
 
 
342 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.21 
 
 
326 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
342 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  30.75 
 
 
328 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>