More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1113 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
341 aa  695    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.35 
 
 
342 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.06 
 
 
342 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 
342 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
342 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.43 
 
 
342 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
340 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.47 
 
 
339 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
340 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 
340 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  40.71 
 
 
340 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.83 
 
 
350 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
344 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.26 
 
 
340 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
361 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.66 
 
 
346 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.38 
 
 
342 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
358 aa  236  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.03 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.65 
 
 
342 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.84 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
342 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  35.84 
 
 
342 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.55 
 
 
340 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  39.55 
 
 
340 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.58 
 
 
342 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
347 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.27 
 
 
342 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
360 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.91 
 
 
340 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 
340 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.51 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
339 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  36.26 
 
 
345 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.76 
 
 
341 aa  208  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
341 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.28 
 
 
352 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.94 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
339 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.15 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
333 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.33 
 
 
334 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.93 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.93 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.84 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.02 
 
 
334 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.16 
 
 
326 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
338 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
335 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.19 
 
 
338 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
339 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.11 
 
 
332 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
336 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.03 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.03 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.24 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  33.81 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  33.81 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  34.09 
 
 
328 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.09 
 
 
328 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.61 
 
 
334 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
339 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.61 
 
 
341 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
337 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.26 
 
 
326 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  33.81 
 
 
328 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.52 
 
 
338 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.94 
 
 
327 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.13 
 
 
337 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.05 
 
 
336 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  29.18 
 
 
325 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
337 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.03 
 
 
328 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
328 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1696  hypothetical protein  33.73 
 
 
333 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.52 
 
 
328 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
332 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  29.83 
 
 
332 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.82 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.51 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.96 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.48 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.77 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1697  hypothetical protein  33.73 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.82 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.9 
 
 
328 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  28.86 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.88 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.98 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>