More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2357 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  77.22 
 
 
338 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.46 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.64 
 
 
339 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  56.34 
 
 
339 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 
337 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  41.32 
 
 
327 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.47 
 
 
341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.24 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.24 
 
 
342 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 
342 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.13 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
344 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.18 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
339 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.75 
 
 
340 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.76 
 
 
341 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
339 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.58 
 
 
321 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
339 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
347 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  33.52 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.99 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  35.74 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
361 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  34.99 
 
 
324 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
342 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.9 
 
 
342 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
342 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.82 
 
 
352 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
340 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.66 
 
 
342 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.61 
 
 
342 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
345 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
340 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
342 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.91 
 
 
340 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
340 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.28 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.37 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.62 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
319 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
340 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
341 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
324 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
340 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.89 
 
 
319 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
334 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
336 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 
326 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 
326 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
319 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.16 
 
 
342 aa  159  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
326 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
336 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
326 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.29 
 
 
334 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.83 
 
 
322 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
324 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.2 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.58 
 
 
324 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
321 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
308 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
326 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
326 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.2 
 
 
325 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.2 
 
 
328 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.12 
 
 
322 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
333 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
337 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.58 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
326 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.29 
 
 
324 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
331 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
340 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.82 
 
 
334 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
335 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.91 
 
 
321 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 
325 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
324 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
358 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  29.11 
 
 
436 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  32.23 
 
 
451 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  27.5 
 
 
436 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.61 
 
 
325 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.35 
 
 
326 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.52 
 
 
359 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.71 
 
 
319 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>