More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1276 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
322 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  75.08 
 
 
325 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.67 
 
 
322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  68.22 
 
 
320 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  64.29 
 
 
321 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  66.04 
 
 
319 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.49 
 
 
321 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1225  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.99 
 
 
322 aa  401  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.84 
 
 
322 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7575  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.49 
 
 
313 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0982  alcohol dehydrogenase  61.42 
 
 
324 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  60.25 
 
 
334 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3750  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.61 
 
 
326 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220765  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.19 
 
 
321 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  60.87 
 
 
319 aa  355  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  58.07 
 
 
321 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.15 
 
 
320 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.12 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  54.08 
 
 
330 aa  333  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0607  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60 
 
 
319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2114  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.37 
 
 
325 aa  321  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.828454  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1267  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.88 
 
 
322 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.370033  normal  0.178282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3694  alcohol dehydrogenase  53.27 
 
 
338 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4074  alcohol dehydrogenase  53.27 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.63 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.24 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
339 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 
345 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 
342 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.78 
 
 
350 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
339 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
342 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
347 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.69 
 
 
334 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
329 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
329 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.53 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.31 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.85 
 
 
341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.31 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
331 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.78 
 
 
342 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
344 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.66 
 
 
329 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
340 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
346 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
339 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.81 
 
 
340 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.7 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
338 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
339 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.72 
 
 
340 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
339 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
338 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
340 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
361 aa  139  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.31 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
336 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
337 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
332 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
340 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.56 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
340 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
337 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  31.52 
 
 
342 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.63 
 
 
342 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
342 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.33 
 
 
342 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.13 
 
 
322 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
342 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  31.2 
 
 
418 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 
352 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
336 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
336 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  32.72 
 
 
337 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
336 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 
335 aa  125  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
348 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.08 
 
 
336 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.65 
 
 
342 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
336 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.65 
 
 
342 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.55 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
336 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>