More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1562 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  61.32 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.03 
 
 
355 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.89 
 
 
357 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  60.86 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  57.88 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  55.87 
 
 
364 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20460  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  51.93 
 
 
368 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  49.42 
 
 
352 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.59 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2921  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.28 
 
 
375 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503064  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
361 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.84 
 
 
360 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.87 
 
 
376 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.1709  normal  0.22492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4868  alcohol dehydrogenase  49.06 
 
 
377 aa  292  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0291  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
380 aa  268  8.999999999999999e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2340  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1955  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
360 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2142  alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.82 
 
 
342 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.1 
 
 
342 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  37.33 
 
 
337 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
339 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
342 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.29 
 
 
350 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
339 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
339 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.14 
 
 
341 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
342 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
339 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
327 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01183  hypothetical oxidoreductase protein  48.37 
 
 
195 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
346 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
328 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
341 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
341 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
329 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
347 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
330 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
361 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
337 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.79 
 
 
329 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.98 
 
 
334 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.4 
 
 
336 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
329 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
346 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.42 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.91 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.16 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.2 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.15 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.77 
 
 
334 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.45 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
331 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.93 
 
 
325 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.04 
 
 
336 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  33.94 
 
 
320 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  31.01 
 
 
332 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.56 
 
 
326 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.91 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.91 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.04 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.91 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.74 
 
 
319 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
329 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.14 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.08 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.76 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.92 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.66 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.84 
 
 
325 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
325 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
334 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
335 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
324 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
319 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
325 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.22 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.9 
 
 
331 aa  132  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0905  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.586977  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.4 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.61 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>