More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
392 aa  772    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  71.55 
 
 
366 aa  524  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  68.18 
 
 
357 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.52 
 
 
355 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.81 
 
 
357 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  64.51 
 
 
364 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.86 
 
 
348 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2340  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.75 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 
352 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.62 
 
 
376 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.57 
 
 
360 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  46.78 
 
 
349 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2142  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
380 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4868  alcohol dehydrogenase  47.34 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0291  alcohol dehydrogenase  47.41 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2921  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.28 
 
 
375 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503064  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20460  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  47.38 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.25 
 
 
376 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.1709  normal  0.22492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
361 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1955  alcohol dehydrogenase  39.29 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.72 
 
 
342 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.72 
 
 
342 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
337 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
339 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
342 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
337 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
339 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.89 
 
 
350 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
344 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01183  hypothetical oxidoreductase protein  44.32 
 
 
195 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
327 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
342 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.88 
 
 
341 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.36 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.02 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
328 aa  135  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
347 aa  133  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
341 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.49 
 
 
342 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.57 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  31.75 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.65 
 
 
359 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
331 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
339 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  31.48 
 
 
325 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
326 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.88 
 
 
329 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.36 
 
 
325 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.32 
 
 
334 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
326 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.62 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.62 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.92 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.87 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.62 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.9 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
361 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
341 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  27.78 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.44 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.19 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  30.75 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.53 
 
 
323 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
325 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.48 
 
 
331 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
329 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.28 
 
 
336 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.09 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.09 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.64 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.28 
 
 
328 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  30.91 
 
 
328 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
329 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.64 
 
 
336 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
333 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.56 
 
 
334 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.64 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.93 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
328 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
334 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
322 aa  113  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
334 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
328 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01925  quinone oxidoreductase  29.12 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>