More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2578 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  724    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  83 
 
 
349 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  70.11 
 
 
360 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2921  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.08 
 
 
375 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503064  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20460  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  55.4 
 
 
368 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.65 
 
 
376 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.47 
 
 
361 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.13 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.58 
 
 
355 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.73 
 
 
357 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  45.85 
 
 
392 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.67 
 
 
376 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.1709  normal  0.22492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4868  alcohol dehydrogenase  43.63 
 
 
377 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  44.25 
 
 
366 aa  288  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  42.86 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1955  alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 
360 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2340  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2142  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
380 aa  228  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0291  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
380 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01183  hypothetical oxidoreductase protein  54.4 
 
 
195 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
338 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.92 
 
 
342 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
342 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
342 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
337 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.6 
 
 
332 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.41 
 
 
336 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
339 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  30.41 
 
 
336 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
337 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  30.41 
 
 
336 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
339 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.41 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.06 
 
 
323 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.4 
 
 
369 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.52 
 
 
334 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
342 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
337 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.89 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.52 
 
 
356 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.46 
 
 
331 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.97 
 
 
342 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 
332 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.63 
 
 
320 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.49 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.93 
 
 
639 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.23 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
332 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
341 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
339 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.82 
 
 
320 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.69 
 
 
338 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 
333 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.34 
 
 
326 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.04 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.7 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.35 
 
 
341 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.14 
 
 
326 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.43 
 
 
338 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
325 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  30.08 
 
 
347 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.81 
 
 
326 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.83 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.75 
 
 
336 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
327 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.18 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.43 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.91 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.48 
 
 
346 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.77 
 
 
335 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  30.28 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.01 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.18 
 
 
328 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.77 
 
 
336 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.78 
 
 
327 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.14 
 
 
327 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.49 
 
 
336 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  29.33 
 
 
328 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
335 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>