More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01183 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01183  hypothetical oxidoreductase protein  100 
 
 
195 aa  396  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2921  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.12 
 
 
375 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503064  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1955  alcohol dehydrogenase  63.13 
 
 
360 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  55.25 
 
 
349 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  54.4 
 
 
352 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
360 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20460  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  55 
 
 
368 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 
366 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.2 
 
 
355 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  45.65 
 
 
364 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.28 
 
 
348 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.11 
 
 
357 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  44.57 
 
 
357 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.32 
 
 
392 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.22 
 
 
376 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 
361 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.39 
 
 
376 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.1709  normal  0.22492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4868  alcohol dehydrogenase  40.22 
 
 
377 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 
337 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
337 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
339 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0291  alcohol dehydrogenase  34.54 
 
 
380 aa  94.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
327 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.32 
 
 
350 aa  91.7  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
323 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
344 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.24 
 
 
341 aa  89.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.92 
 
 
356 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
338 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
345 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
345 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 
369 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
341 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
325 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
339 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
328 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
342 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
329 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.46 
 
 
334 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.89 
 
 
342 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
329 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.82 
 
 
322 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.97 
 
 
329 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
347 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.04 
 
 
323 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.35 
 
 
342 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
329 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.4 
 
 
329 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.7 
 
 
639 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.89 
 
 
342 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.46 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.4 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.2 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.53 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
339 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  29.61 
 
 
342 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.63 
 
 
323 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2142  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
380 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
332 aa  81.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.83 
 
 
322 aa  81.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.43 
 
 
342 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
333 aa  81.3  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
324 aa  81.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  27.98 
 
 
5802 aa  81.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.68 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.68 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.96 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.81 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.81 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.96 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.81 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3022  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0720259  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.19 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  32.63 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.48 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.63 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.58 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.65 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.26 
 
 
336 aa  79  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.72 
 
 
341 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 
327 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.95 
 
 
313 aa  78.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.28 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.29 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.11 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.02 
 
 
332 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
342 aa  78.2  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.49 
 
 
342 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.16 
 
 
311 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>