More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3808 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
323 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.04 
 
 
323 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.8 
 
 
323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.35 
 
 
324 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3096  putative NADPH quinone oxidoreductase  42.26 
 
 
322 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.751832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2020  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 
322 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2150  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3434  alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0491212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3022  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40 
 
 
328 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0720259  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.23 
 
 
332 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  39.68 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.84 
 
 
327 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.5 
 
 
329 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.5 
 
 
329 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
332 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.83 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  36.06 
 
 
328 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  37 
 
 
326 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4930  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.58 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.67 
 
 
332 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.19 
 
 
326 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4208  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.87 
 
 
326 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.65 
 
 
333 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4084  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
326 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.87 
 
 
326 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.94 
 
 
338 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
327 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.9 
 
 
335 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.54 
 
 
336 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.34 
 
 
327 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  34.74 
 
 
332 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.69 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.76 
 
 
338 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
333 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.65 
 
 
335 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
325 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.04 
 
 
334 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.36 
 
 
336 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  34.81 
 
 
325 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.36 
 
 
336 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3909  alcohol dehydrogenase  35.89 
 
 
331 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0317152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
332 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.86 
 
 
328 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.45 
 
 
328 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  32.81 
 
 
336 aa  165  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.83 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0832  alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000430219  normal  0.313635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1088  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.93 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.54 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.73 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.64 
 
 
320 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0180  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
329 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.089146  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.56 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
345 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
345 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.76 
 
 
328 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  34.57 
 
 
328 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
333 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.62 
 
 
338 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.45 
 
 
343 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 
353 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.66 
 
 
335 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 
332 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.64 
 
 
341 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.6 
 
 
337 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  31.37 
 
 
336 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.37 
 
 
336 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.01 
 
 
324 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  32.32 
 
 
356 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  31.37 
 
 
336 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.63 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.24 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.63 
 
 
334 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21890  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
320 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.7 
 
 
331 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.45 
 
 
342 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
335 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1869  putative oxidoreductase  33.65 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
332 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.12 
 
 
325 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.44 
 
 
316 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.29 
 
 
342 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  35.38 
 
 
338 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.91 
 
 
326 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.53 
 
 
333 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.55 
 
 
334 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.72 
 
 
324 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1680  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.79 
 
 
320 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.83 
 
 
338 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3884  oxidoreductase, zinc-binding protein  32.06 
 
 
320 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
339 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1600  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.06 
 
 
320 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0398631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.53 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
342 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>