More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2855 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2855  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
360 aa  739    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0227  alcohol dehydrogenase  74.49 
 
 
349 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2578  alcohol dehydrogenase  70.11 
 
 
352 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711518  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2921  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 
375 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.503064  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20460  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  55.68 
 
 
368 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5230  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.04 
 
 
357 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  0.793838 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5498  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.04 
 
 
355 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3705  alcohol dehydrogenase  46.07 
 
 
357 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.78 
 
 
376 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229164  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.28 
 
 
376 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.1709  normal  0.22492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.05 
 
 
361 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04630  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  46.57 
 
 
392 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.55 
 
 
348 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1955  alcohol dehydrogenase  47.44 
 
 
360 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.588479  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  44.19 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2059  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4868  alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 
377 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2340  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0291  alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2142  alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
380 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01183  hypothetical oxidoreductase protein  54.24 
 
 
195 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.52 
 
 
342 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
337 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.24 
 
 
342 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
342 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
337 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
333 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
339 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
338 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
327 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
342 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.06 
 
 
342 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.42 
 
 
336 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.96 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
337 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
339 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.39 
 
 
332 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.83 
 
 
338 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.03 
 
 
323 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.49 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.68 
 
 
369 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
332 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.75 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.83 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.83 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  29.83 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
326 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
328 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
346 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.19 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  30.94 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.58 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.21 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
333 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
350 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.83 
 
 
334 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.23 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.18 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  31.86 
 
 
325 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
313 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.02 
 
 
328 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.19 
 
 
334 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.64 
 
 
328 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.11 
 
 
338 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
361 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.89 
 
 
326 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
339 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.59 
 
 
335 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.66 
 
 
308 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.08 
 
 
329 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.61 
 
 
328 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.25 
 
 
324 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  29.33 
 
 
328 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.37 
 
 
329 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
329 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.36 
 
 
359 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  29.05 
 
 
328 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  32.65 
 
 
305 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.05 
 
 
328 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  29.05 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.03 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  29.56 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>