More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0905 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0905  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
350 aa  712    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.586977  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.05 
 
 
331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  61.21 
 
 
330 aa  408  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.4 
 
 
330 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0438  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
328 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.63 
 
 
342 aa  169  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.41 
 
 
342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
342 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.41 
 
 
342 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
342 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
341 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.7 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.16 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
342 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
349 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.88 
 
 
339 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.62 
 
 
353 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.66 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.61 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  31.88 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.12 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  28.93 
 
 
358 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.84 
 
 
336 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.44 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
340 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.41 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.15 
 
 
335 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
324 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  28.69 
 
 
325 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.66 
 
 
325 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.63 
 
 
326 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.98 
 
 
326 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  30.84 
 
 
322 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.21 
 
 
334 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
340 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  28.69 
 
 
325 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
322 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.08 
 
 
347 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
325 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
322 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.88 
 
 
325 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
325 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
322 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 
325 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
348 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.14 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.53 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.43 
 
 
328 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.44 
 
 
338 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
338 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.99 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.87 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  27.67 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1640  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.29 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.140848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.59 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.8 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.23 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  30.81 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  30.29 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  31.18 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.53 
 
 
334 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
335 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
342 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.38 
 
 
334 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
325 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.99 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.86 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.75 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.57 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>