More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1225 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1225  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
322 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  77.81 
 
 
321 aa  512  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.49 
 
 
321 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  62.62 
 
 
319 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8289  putative oxidoreductase  63.75 
 
 
320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.055807  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1276  alcohol dehydrogenase  61.99 
 
 
322 aa  401  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.914753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3680  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.36 
 
 
322 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1728  alcohol dehydrogenase  62.04 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.13 
 
 
320 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4029  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.18 
 
 
322 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7575  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.88 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0584  alcohol dehydrogenase  55.9 
 
 
334 aa  352  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0645206  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0982  alcohol dehydrogenase  56.35 
 
 
324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711681  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.49 
 
 
321 aa  351  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3750  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.39 
 
 
326 aa  348  8e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220765  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32200  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  57.63 
 
 
319 aa  338  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.497144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5155  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  53.27 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.31 
 
 
319 aa  317  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0607  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.27 
 
 
319 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.105254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1267  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.42 
 
 
322 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.370033  normal  0.178282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0888  NADPH/quinone reductase  48.8 
 
 
330 aa  296  3e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2114  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.87 
 
 
325 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.828454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3694  alcohol dehydrogenase  48.75 
 
 
338 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.250797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4074  alcohol dehydrogenase  48.12 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
339 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
347 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2134  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341881  normal  0.0132134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
339 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
342 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
342 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.45 
 
 
342 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0723  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.8 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.69 
 
 
329 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
329 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
329 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.35 
 
 
329 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.89 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
329 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.35 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.03 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.03 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.17 
 
 
341 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.03 
 
 
329 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.76 
 
 
342 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
342 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.21 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
339 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
341 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
338 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.62 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.19 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.55 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.58 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
340 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
340 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
337 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30 
 
 
342 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
340 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.52 
 
 
367 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
337 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.03 
 
 
340 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.7 
 
 
342 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
342 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.15 
 
 
352 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.15 
 
 
322 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  30.3 
 
 
342 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.54 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0534  alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.6 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  32.6 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.17 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
361 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
337 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
340 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.66 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
340 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.5 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.06 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.41 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.27 
 
 
322 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.1 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.85 
 
 
337 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
339 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.13 
 
 
336 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.68 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
324 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.68 
 
 
342 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
337 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
322 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>