More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5367 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5367  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
332 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.18 
 
 
336 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
338 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.24 
 
 
338 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2505  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
337 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  49.56 
 
 
337 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.59 
 
 
337 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
336 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1431  alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 
337 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1266  putative alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
336 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.0791348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  46.59 
 
 
336 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  48.53 
 
 
339 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.4 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6065  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.15 
 
 
335 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.01709 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6869  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.405297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2290  putative alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282734  normal  0.0576667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 
335 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.56 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3980  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  47.18 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0371  alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 
335 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07636  oxidoreductase (Eurofung)  41.98 
 
 
353 aa  261  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.499872  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2595  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.62 
 
 
339 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.519018  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3539  alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
339 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.91 
 
 
336 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
336 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.86 
 
 
335 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.86 
 
 
335 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.86 
 
 
335 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.86 
 
 
405 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.86 
 
 
378 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.86 
 
 
405 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.86 
 
 
335 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
336 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
336 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1153  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.77 
 
 
336 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.21 
 
 
335 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1337  oxidoreductase, zinc-binding protein  42.47 
 
 
336 aa  255  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.71 
 
 
332 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1436  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.97 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  44.07 
 
 
347 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5137  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 
339 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138562  normal  0.497782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
338 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1660  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.67 
 
 
337 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0945841  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6380  alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 
335 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0434732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  44.58 
 
 
339 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0745  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.45 
 
 
339 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2362  alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
367 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0566  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.39 
 
 
343 aa  225  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329939  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0980  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
341 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.449536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.16 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0362  alcohol dehydrogenase  40.61 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2700  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
334 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739521  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 
342 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525287  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2233  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 
352 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.5 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3286  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.13 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.135792  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4979  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.34 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403893  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09366  conserved hypothetical protein  37.91 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00133141  normal  0.0115183 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00280  alcohol dehydrogenase, putative  35.8 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.55 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.55 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06439  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 
358 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.21 
 
 
322 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
359 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0026  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.69 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
342 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
342 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 
339 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.23 
 
 
327 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
347 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
329 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.24 
 
 
341 aa  159  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.59 
 
 
342 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
344 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
329 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
339 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.23 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2390  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.14 
 
 
329 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
324 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  33.81 
 
 
332 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
338 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2715  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.44 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.34 
 
 
328 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.83 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2664  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.14 
 
 
329 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000739003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2466  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.14 
 
 
329 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2429  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.14 
 
 
329 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000105072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2647  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
329 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.36 
 
 
329 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.66 
 
 
338 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 
336 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>