More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1174 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 333 aa  666    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.26 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  60.79 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 337 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  54.85 
 
 		 334 aa  335  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  51.05 
 
 		 326 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.3 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  53.15 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  50 
 
 		 325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.8 
 
 		 325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  48.49 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  48.19 
 
 		 325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  48.35 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.3 
 
 		 324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.64 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.19 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 		 325 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 		 325 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.31 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  49.24 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  47.9 
 
 		 326 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.27 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 		 361 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.39 
 
 		 325 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 326 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 326 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.04 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.04 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 		 324 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.79 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.13 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.83 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  47.58 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  46.83 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.67 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  46.97 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.76 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.33 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  47.5 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.67 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  45.96 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  43.67 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.06 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  43.94 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  40.96 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  38.92 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.42 
 
 		 329 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.32 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.17 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.3 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.99 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.36 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  40.61 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  38.07 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.86 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  42.17 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  39.7 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.27 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.76 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.86 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.56 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>