More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2099 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
324 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  91.98 
 
 
361 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  84.26 
 
 
324 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.26 
 
 
324 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  83.95 
 
 
324 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  73.46 
 
 
324 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  72.22 
 
 
324 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  70.99 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.63 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  60.87 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  61.18 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  57.59 
 
 
325 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.59 
 
 
328 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  62.05 
 
 
334 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.58 
 
 
324 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  61.3 
 
 
324 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  59.44 
 
 
326 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.68 
 
 
325 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 
324 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.68 
 
 
324 aa  374  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.66 
 
 
325 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  61.73 
 
 
324 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  56.66 
 
 
325 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  56.66 
 
 
325 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.23 
 
 
324 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  56.17 
 
 
325 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.3 
 
 
324 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  61.61 
 
 
324 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
326 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
326 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
326 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 
325 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  57.41 
 
 
326 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  59.75 
 
 
324 aa  352  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.41 
 
 
326 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
326 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  56.79 
 
 
326 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.63 
 
 
328 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  52.78 
 
 
324 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  60.68 
 
 
326 aa  341  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  58.39 
 
 
325 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.47 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.16 
 
 
324 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 
324 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
324 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 
324 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
331 aa  324  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 
324 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.45 
 
 
326 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.14 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
324 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.69 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.53 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  51.66 
 
 
332 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 
323 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  45.62 
 
 
337 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 
326 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
324 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
340 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.38 
 
 
327 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  47.99 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  46.89 
 
 
325 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
319 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.52 
 
 
325 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 
324 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
326 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 
332 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  43.83 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
319 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
324 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 
319 aa  241  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
319 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.61 
 
 
322 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.48 
 
 
326 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
329 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
335 aa  231  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.43 
 
 
326 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
335 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 
322 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.56 
 
 
325 aa  222  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.54 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  43.56 
 
 
331 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
321 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
321 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  41.93 
 
 
325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3749  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
325 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
325 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
327 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1046  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.15 
 
 
322 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0321902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  40.67 
 
 
331 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 
331 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
323 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>