More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1796 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 328 aa  668    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  85.06 
 
 		 324 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  82.62 
 
 		 324 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  86.28 
 
 		 324 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  81.1 
 
 		 324 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  81.1 
 
 		 324 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  80.18 
 
 		 324 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  82.32 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  78.66 
 
 		 324 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  68.4 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.63 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.51 
 
 		 324 aa  358  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.51 
 
 		 324 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  58.9 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.82 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.28 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  57.98 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  52.45 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  52.91 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  52.15 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.38 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  55.83 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  50.15 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.75 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  56.57 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.39 
 
 		 325 aa  318  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 		 325 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.24 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.99 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  51.68 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.15 
 
 		 326 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.62 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.77 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.93 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 		 340 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.25 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.8 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.09 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 		 323 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  42.54 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.64 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.88 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  42.22 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  43.13 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 		 319 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.68 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  43.23 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  40.8 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.93 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  40.49 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.63 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  40.67 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.49 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.84 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.41 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.57 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.93 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.57 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2450  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 		 323 aa  199  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>