More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0674 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 319 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  89.34 
 
 		 319 aa  540  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  89.66 
 
 		 319 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  67.4 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.04 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  53.63 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.21 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  47.23 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  47.06 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  46.41 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  47.23 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  46.1 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 		 324 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.75 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.28 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  43.46 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.71 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.9 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.81 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  46.1 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.22 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.78 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  44.81 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  44.75 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  45.6 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  45.02 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.75 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.12 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.24 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  45.37 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.81 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  43.95 
 
 		 340 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.55 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.99 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.26 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.31 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.87 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.18 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  43.93 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  43.51 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  42.22 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 331 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.46 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  40.73 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.2 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  41.75 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.57 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.08 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.91 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.69 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.65 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.53 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.65 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.26 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  40.19 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>