More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0404 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 324 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  95.37 
 
 		 324 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  94.14 
 
 		 324 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  93.21 
 
 		 324 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  89.51 
 
 		 324 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.63 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  55.86 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  55.28 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.66 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.97 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  53.73 
 
 		 326 aa  348  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  52.16 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 		 334 aa  342  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  53.7 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.39 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.01 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.01 
 
 		 324 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 		 361 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  50 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.16 
 
 		 324 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.78 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  49.85 
 
 		 325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  53.09 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  49.85 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 325 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  54.94 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.38 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.78 
 
 		 324 aa  309  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.38 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.93 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  47.13 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.93 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  48.14 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  48.85 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  47.83 
 
 		 326 aa  268  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.58 
 
 		 324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  45.15 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.79 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  44.48 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.28 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  45.22 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 323 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  41.74 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.55 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  44.3 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.25 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.58 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.51 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.94 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  40.79 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  38.7 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3749  alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.25 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  39.14 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  37.54 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.41 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>