More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0091 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  81.17 
 
 
324 aa  524  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  79.32 
 
 
324 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  81.48 
 
 
324 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  80.25 
 
 
324 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  80.25 
 
 
324 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  79.32 
 
 
324 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  78.66 
 
 
328 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  79.01 
 
 
326 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  68.63 
 
 
325 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.75 
 
 
324 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.01 
 
 
324 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.01 
 
 
324 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  58.39 
 
 
324 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.01 
 
 
361 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  58.7 
 
 
324 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
325 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  53.73 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.11 
 
 
325 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.83 
 
 
324 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  57.76 
 
 
324 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  54.8 
 
 
325 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  53.42 
 
 
325 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.25 
 
 
328 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  52.62 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.48 
 
 
325 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
326 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
325 aa  328  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.45 
 
 
324 aa  326  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  55.73 
 
 
326 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
326 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 
324 aa  318  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
326 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
326 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  52.57 
 
 
334 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  54.18 
 
 
326 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.56 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.46 
 
 
325 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  292  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
324 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.06 
 
 
324 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.96 
 
 
324 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.58 
 
 
324 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
324 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  46.89 
 
 
324 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 
324 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.21 
 
 
326 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  46.53 
 
 
337 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 
326 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.29 
 
 
326 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  45 
 
 
333 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.65 
 
 
326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
326 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
323 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
332 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  44.85 
 
 
340 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  44.05 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  42.53 
 
 
319 aa  241  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.91 
 
 
327 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
323 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
326 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.3 
 
 
326 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 
327 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.63 
 
 
322 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
335 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  40.87 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  43.69 
 
 
329 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 
332 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  42.24 
 
 
325 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
321 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.59 
 
 
325 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
321 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  41.77 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
321 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 
331 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 
325 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
324 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.12 
 
 
325 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.77 
 
 
327 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
329 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 
322 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
324 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.01 
 
 
322 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  41.18 
 
 
319 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  43.09 
 
 
324 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
331 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  40.85 
 
 
319 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.38 
 
 
322 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
335 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.17 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.46 
 
 
331 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>