More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0406 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 326 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.07 
 
 		 324 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 		 324 aa  342  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.29 
 
 		 326 aa  339  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.73 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.73 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  52.8 
 
 		 324 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.48 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 		 323 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  47.52 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  51.55 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  46.58 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.13 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.45 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  47.27 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.89 
 
 		 325 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  46.89 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 		 332 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  48.45 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  47.37 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  44.72 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.83 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.79 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.83 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.14 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.27 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 331 aa  255  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  46.13 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.82 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.48 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 		 324 aa  249  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.38 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  44.27 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.43 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  42.68 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.99 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  41.16 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.52 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.13 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.52 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3749  alcohol dehydrogenase  44.1 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4202  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  41.74 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  42.58 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.62 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.23 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.81 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.14 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>