More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4910 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.41 
 
 
326 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.23 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2450  alcohol dehydrogenase  47.59 
 
 
323 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.97 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 
324 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 
326 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  42.86 
 
 
325 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.31 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  42.15 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.9 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 
325 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
332 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40 
 
 
326 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  41.58 
 
 
325 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
326 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
326 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  42.95 
 
 
324 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  39.03 
 
 
325 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
324 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  44.52 
 
 
325 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
323 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  39.01 
 
 
325 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.8 
 
 
325 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 
326 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
326 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.69 
 
 
325 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
326 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.32 
 
 
328 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.05 
 
 
324 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 
324 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
324 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.04 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.35 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.72 
 
 
326 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  43.29 
 
 
324 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  42.68 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.74 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.03 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 
324 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.03 
 
 
324 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
326 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
324 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 
337 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  42.48 
 
 
323 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 
319 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
324 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
361 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  41.77 
 
 
326 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
324 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 
324 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
324 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  39.74 
 
 
319 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  41.03 
 
 
324 aa  188  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
324 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  39.74 
 
 
319 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 
324 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1046  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.67 
 
 
322 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0321902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
326 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 
340 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.11 
 
 
324 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  41 
 
 
326 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.46 
 
 
319 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  41.95 
 
 
322 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
325 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  37.82 
 
 
322 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 
325 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  39.38 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
324 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.16 
 
 
327 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  36.51 
 
 
331 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  41.53 
 
 
322 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
335 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.01 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.14 
 
 
329 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.23 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  38.83 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.59 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
324 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
324 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  36.31 
 
 
320 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.62 
 
 
324 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  36.62 
 
 
329 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.61 
 
 
325 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  34.1 
 
 
323 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
321 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>