More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0882 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0882  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2114  putative alcohol dehydrogenase  76.74 
 
 
331 aa  488  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0785  putative alcohol dehydrogenase  73.86 
 
 
331 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0151749  normal  0.604245 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1770  putative alcohol dehydrogenase  74.85 
 
 
331 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.754529  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.89 
 
 
336 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.96 
 
 
333 aa  237  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1615  putative alcohol dehydrogenase  44.37 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.923405  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0398  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.859369  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
322 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
322 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.73 
 
 
336 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.14 
 
 
331 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
342 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.83 
 
 
357 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.83 
 
 
341 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  35.5 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  34.53 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
343 aa  155  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
342 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.14 
 
 
341 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.2 
 
 
342 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
342 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
341 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.9 
 
 
342 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.04 
 
 
342 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
344 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
342 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
347 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.85 
 
 
341 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.12 
 
 
337 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
340 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
346 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.6 
 
 
336 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
336 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
342 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.54 
 
 
342 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
344 aa  149  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.87 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  34.22 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 
340 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
342 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
342 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.99 
 
 
344 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.99 
 
 
344 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
348 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 
335 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.38 
 
 
342 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
344 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
338 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.36 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0950  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.59 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
343 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0831  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.59 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.48 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.19 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.06 
 
 
342 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.74 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.12 
 
 
342 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 
342 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
340 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
338 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
341 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.54 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.211345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.06 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.27 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.47 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 
340 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
330 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0584  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
361 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 
351 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>