More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2703 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
348 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  71.63 
 
 
349 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  66.76 
 
 
358 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
348 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  55.17 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  54.86 
 
 
348 aa  358  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.15 
 
 
343 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  40.4 
 
 
356 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.45 
 
 
368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
370 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
370 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.82 
 
 
355 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.8 
 
 
356 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  33.7 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.61 
 
 
360 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
365 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.42 
 
 
366 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 
366 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.99 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.09 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4519  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.14 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.38 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.99 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.13 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.32 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.85 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  23.92 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.17 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.54 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.39 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0970  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.09 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.79 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.81 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.66 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.15 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.3 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  26.87 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.81 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  26.24 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.94 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.02 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.93 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  27.14 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  28.14 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  31.36 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.47 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  27.78 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  27.22 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.75 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  25.78 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.25 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.14 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  25.38 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  26.56 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  28.62 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.08 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.67 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  25.35 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.7 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.56 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.63 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.72 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  32.25 
 
 
332 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  31 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.14 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  26.57 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  29.82 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.08 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  30.92 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  29.01 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.76 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  26.63 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.33 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  30.92 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.19 
 
 
341 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>