More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1535 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  715    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  74.41 
 
 
380 aa  550  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 
333 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  60.18 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  59.05 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  57.56 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.05 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  59.05 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.83 
 
 
332 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.52 
 
 
334 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.42 
 
 
323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.12 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  53.01 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  54.22 
 
 
332 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  49.3 
 
 
358 aa  352  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 
337 aa  342  7e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.11 
 
 
332 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.33 
 
 
338 aa  311  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.37 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.9 
 
 
332 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.37 
 
 
332 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.43 
 
 
327 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.94 
 
 
324 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  47.31 
 
 
328 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  45.13 
 
 
336 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.51 
 
 
328 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.04 
 
 
329 aa  288  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 
334 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  46.62 
 
 
329 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  47.87 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.01 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.02 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.31 
 
 
341 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.71 
 
 
331 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.72 
 
 
330 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  47 
 
 
327 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.21 
 
 
327 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  46.54 
 
 
327 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.2 
 
 
329 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.59 
 
 
347 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.69 
 
 
342 aa  276  6e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.92 
 
 
328 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  43.04 
 
 
328 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.03 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.6 
 
 
332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  45.83 
 
 
327 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.16 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.16 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  43.03 
 
 
328 aa  272  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  42.41 
 
 
328 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.62 
 
 
331 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.44 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.2 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.71 
 
 
327 aa  269  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.71 
 
 
327 aa  269  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
328 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.6 
 
 
328 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.58 
 
 
328 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.58 
 
 
328 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.47 
 
 
336 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
328 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.58 
 
 
328 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.47 
 
 
336 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.49 
 
 
327 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.58 
 
 
328 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  39.77 
 
 
344 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.15 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.54 
 
 
328 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.41 
 
 
329 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  44.06 
 
 
334 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.48 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
329 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 
329 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.8 
 
 
329 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.53 
 
 
345 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.35 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.32 
 
 
327 aa  242  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.53 
 
 
326 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.38 
 
 
327 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.05 
 
 
304 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.88 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
340 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.33 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  33.05 
 
 
338 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
340 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
342 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
342 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
341 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
342 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.08 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.14 
 
 
341 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  45.86 
 
 
188 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
343 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>