More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2709 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 
334 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  81.87 
 
 
332 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  67.57 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  64.69 
 
 
358 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  69.07 
 
 
338 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  69.07 
 
 
338 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  69.07 
 
 
338 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  67.77 
 
 
332 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  64.09 
 
 
346 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  68.58 
 
 
332 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  65.77 
 
 
333 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  68.28 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  63.1 
 
 
337 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
348 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.63 
 
 
323 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.12 
 
 
332 aa  362  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
380 aa  360  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.41 
 
 
332 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.54 
 
 
338 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 
332 aa  315  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.6 
 
 
327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.1 
 
 
329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  51.41 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  49.55 
 
 
336 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.9 
 
 
331 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  52.38 
 
 
328 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  51.04 
 
 
327 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.78 
 
 
330 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.16 
 
 
332 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.8 
 
 
332 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.62 
 
 
347 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.47 
 
 
328 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 
336 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.62 
 
 
329 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 
336 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.53 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.53 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 
329 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.81 
 
 
324 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  48.35 
 
 
333 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.75 
 
 
327 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.06 
 
 
328 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.05 
 
 
327 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.05 
 
 
327 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  48.05 
 
 
327 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.75 
 
 
327 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.94 
 
 
329 aa  285  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.45 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  51.2 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  49.21 
 
 
338 aa  281  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.94 
 
 
332 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.48 
 
 
328 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.44 
 
 
328 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  44.05 
 
 
328 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.81 
 
 
328 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  49.52 
 
 
329 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.9 
 
 
341 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.99 
 
 
327 aa  278  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.31 
 
 
328 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  43.45 
 
 
328 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.5 
 
 
344 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  48.8 
 
 
327 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  46.11 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.65 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.38 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.38 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.38 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  49.38 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.38 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  49.38 
 
 
328 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.31 
 
 
342 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
334 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  49.68 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.44 
 
 
331 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.62 
 
 
345 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  45.95 
 
 
329 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.02 
 
 
327 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.39 
 
 
327 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.05 
 
 
326 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.08 
 
 
304 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  37.12 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41 
 
 
342 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.02 
 
 
338 aa  235  7e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.62 
 
 
326 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
338 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.28 
 
 
342 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
344 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.56 
 
 
341 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 
337 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.37 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  36.2 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.28 
 
 
341 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.4 
 
 
335 aa  182  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.28 
 
 
341 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.28 
 
 
341 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.28 
 
 
341 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>