More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1505 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  100 
 
 		 334 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  82.07 
 
 		 336 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  82.07 
 
 		 336 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.56 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.55 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  67.07 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  66.77 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.02 
 
 		 328 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  65.55 
 
 		 328 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  64 
 
 		 327 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.66 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  65.03 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.13 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.85 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.85 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.61 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  62.15 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  66.46 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.53 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  61.82 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  63.69 
 
 		 327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.55 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.55 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  64 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.55 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.55 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.23 
 
 		 327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.35 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.54 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  65.55 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  65.55 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.62 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.54 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  61.54 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.62 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.42 
 
 		 324 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.85 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.54 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.46 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.76 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.52 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.86 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  59.69 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  57.01 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.77 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  56.71 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.77 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  56.1 
 
 		 328 aa  384  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.59 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  61.77 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  60.62 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.08 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.62 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.54 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.77 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.77 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.31 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.64 
 
 		 304 aa  351  8e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.31 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.51 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.75 
 
 		 332 aa  322  8e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  52.48 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  51.4 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  78.8 
 
 		 188 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.2 
 
 		 334 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.34 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  46.65 
 
 		 358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.68 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  50.6 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.46 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.62 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.4 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.75 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  48.12 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.86 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  45.06 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  37.92 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.94 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  36.58 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.72 
 
 		 340 aa  175  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.29 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.28 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.5 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.5 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.01 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.12 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.5 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>