More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6106 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 
326 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  83.44 
 
 
326 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  76.15 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  75.23 
 
 
327 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.58 
 
 
327 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.58 
 
 
327 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  69.11 
 
 
327 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  68.81 
 
 
327 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.63 
 
 
328 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.75 
 
 
328 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.75 
 
 
341 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  63.91 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.53 
 
 
327 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.3 
 
 
327 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  63.91 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.63 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  63.91 
 
 
334 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  61.96 
 
 
336 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.43 
 
 
332 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  62.2 
 
 
338 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.96 
 
 
329 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.96 
 
 
328 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.31 
 
 
336 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  57.67 
 
 
328 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.9 
 
 
328 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.69 
 
 
327 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.86 
 
 
332 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.31 
 
 
336 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.59 
 
 
338 aa  371  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.11 
 
 
331 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  62.08 
 
 
328 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 
347 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  62.77 
 
 
334 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.46 
 
 
328 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.12 
 
 
345 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.59 
 
 
329 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.47 
 
 
327 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.44 
 
 
335 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.47 
 
 
327 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.44 
 
 
335 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  61.9 
 
 
329 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.97 
 
 
324 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.08 
 
 
328 aa  361  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.16 
 
 
327 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.21 
 
 
328 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.95 
 
 
329 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  53.37 
 
 
328 aa  359  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  61.77 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  57.93 
 
 
333 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  61.47 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.47 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.82 
 
 
330 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  52.76 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  58.05 
 
 
334 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.47 
 
 
344 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.58 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  57.45 
 
 
329 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.93 
 
 
331 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.69 
 
 
304 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.9 
 
 
332 aa  305  6e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  47.04 
 
 
337 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.35 
 
 
332 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.36 
 
 
334 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  47.98 
 
 
333 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.89 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  44.94 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
332 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
348 aa  252  7e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.45 
 
 
332 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.02 
 
 
323 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  49.37 
 
 
332 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.77 
 
 
332 aa  238  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
333 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.52 
 
 
338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
338 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  45.99 
 
 
346 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  43.27 
 
 
358 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  61.11 
 
 
188 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  34.81 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.52 
 
 
342 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.66 
 
 
342 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.23 
 
 
336 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.58 
 
 
342 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.52 
 
 
342 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
341 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.06 
 
 
341 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
342 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.93 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.37 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  35.37 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>