More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2299 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  80.24 
 
 
329 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  58.66 
 
 
333 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.46 
 
 
338 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  61.4 
 
 
328 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.4 
 
 
336 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.65 
 
 
328 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.4 
 
 
336 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.93 
 
 
328 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.63 
 
 
347 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.71 
 
 
328 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  60.18 
 
 
327 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  58.31 
 
 
338 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  56.33 
 
 
336 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.74 
 
 
329 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.45 
 
 
327 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.71 
 
 
324 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60 
 
 
345 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.88 
 
 
332 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  54.88 
 
 
328 aa  363  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  54.57 
 
 
328 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.48 
 
 
341 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  57.19 
 
 
329 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.75 
 
 
328 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.88 
 
 
329 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.62 
 
 
327 aa  359  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.4 
 
 
335 aa  359  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.4 
 
 
335 aa  359  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.27 
 
 
332 aa  358  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  58.41 
 
 
334 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  53.96 
 
 
328 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.36 
 
 
329 aa  357  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  58.36 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  56.84 
 
 
327 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.96 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.84 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.84 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  58.84 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.84 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  58.84 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.84 
 
 
328 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.45 
 
 
328 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.84 
 
 
327 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  56.67 
 
 
334 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.96 
 
 
329 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.84 
 
 
327 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.36 
 
 
327 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.62 
 
 
344 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.01 
 
 
330 aa  348  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.81 
 
 
327 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.63 
 
 
327 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.87 
 
 
331 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.62 
 
 
327 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
327 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.32 
 
 
328 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.23 
 
 
327 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  55.66 
 
 
329 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.85 
 
 
331 aa  335  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  55.79 
 
 
331 aa  329  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.05 
 
 
326 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.3 
 
 
326 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.14 
 
 
304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  51.45 
 
 
337 aa  305  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  47.96 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  45.02 
 
 
380 aa  288  6e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 
348 aa  288  8e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.35 
 
 
332 aa  285  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43 
 
 
332 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
333 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.48 
 
 
334 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.08 
 
 
323 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
332 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.59 
 
 
332 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 
332 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
332 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.48 
 
 
332 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  46.62 
 
 
338 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.62 
 
 
338 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  46.62 
 
 
338 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  42.69 
 
 
358 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.96 
 
 
344 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.98 
 
 
332 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  43.07 
 
 
346 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.57 
 
 
342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.74 
 
 
338 aa  209  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  55.61 
 
 
188 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.59 
 
 
342 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 
336 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
341 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.92 
 
 
341 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.54 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.54 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  34.46 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.23 
 
 
341 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  33.23 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.75 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>