More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2591 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  98.92 
 
 
370 aa  741    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
370 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37 
 
 
355 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.62 
 
 
360 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.49 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.83 
 
 
365 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.06 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.87 
 
 
368 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.77 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.53 
 
 
354 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 
350 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  33.7 
 
 
348 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  34.77 
 
 
349 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
348 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  33.16 
 
 
358 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
366 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.28 
 
 
356 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
345 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0835  L-threonine 3-dehydrogenase  28.35 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.836502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.54 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  27.9 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.97 
 
 
340 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  24.93 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  24.67 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  24.67 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  25.74 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  24.93 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  24.93 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  24.93 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.92 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  24.93 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  25.47 
 
 
345 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  24.4 
 
 
341 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.05 
 
 
343 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  26.2 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  27.89 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0561  alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.324844  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  24.13 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  24.4 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7063  L-threonine 3-dehydrogenase  27.54 
 
 
344 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  25.06 
 
 
346 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.15 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  25.47 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.53 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  24.4 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  23.86 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  23.86 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  23.86 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.36 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  26.26 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  24.8 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.61 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.02 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  24.21 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.37 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  25.77 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.82 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1306  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.31 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  23.59 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  26.2 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  33.22 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.62 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  23.53 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  23.86 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1594  L-threonine 3-dehydrogenase  25.92 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.073313  normal  0.583452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  23.86 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0050  L-threonine 3-dehydrogenase  24.73 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1353  L-threonine 3-dehydrogenase  25.33 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000813951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  23.86 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3462  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.39 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.22 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1473  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.39 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.22 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  24.26 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1310  L-threonine 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0049  L-threonine 3-dehydrogenase  24.46 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  26.74 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  26.32 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.26 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  24.26 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.73 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  25.33 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  24.26 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  24.26 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  25.33 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204388  normal  0.287337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  27.42 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>