More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0564 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0564  dihydroorotate oxidase  100 
 
 
322 aa  631  1e-180  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0108543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.16 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.05 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.02 
 
 
345 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.75 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.5 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  28.36 
 
 
356 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  32.34 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.62 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  29.18 
 
 
348 aa  112  6e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.82 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.82 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.1 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.02 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.56 
 
 
361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.02 
 
 
356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.02 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.53 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.84 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.35 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.41 
 
 
355 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.3 
 
 
357 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
345 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
345 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  31.72 
 
 
344 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
345 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
345 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
345 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.33 
 
 
342 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  29.97 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  31.93 
 
 
336 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  30.65 
 
 
344 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.72 
 
 
356 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.21 
 
 
377 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.02 
 
 
342 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.2 
 
 
369 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.65 
 
 
341 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  28.57 
 
 
340 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.21 
 
 
344 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.91 
 
 
354 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.59 
 
 
348 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.47 
 
 
377 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3154  dihydroorotate dehydrogenase  28 
 
 
361 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351968  hitchhiker  0.000224626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.31 
 
 
351 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.52 
 
 
351 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.52 
 
 
365 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.52 
 
 
351 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.34 
 
 
336 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.87 
 
 
365 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.88 
 
 
354 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.24 
 
 
344 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.41 
 
 
352 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.82 
 
 
337 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  30.9 
 
 
349 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.7 
 
 
340 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.97 
 
 
350 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  30 
 
 
344 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  26.22 
 
 
356 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.6 
 
 
347 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  30.82 
 
 
355 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.6 
 
 
347 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.74 
 
 
336 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  28.82 
 
 
340 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.15 
 
 
331 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.87 
 
 
344 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.96 
 
 
356 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.77 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.49 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.51 
 
 
339 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  28.82 
 
 
346 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  27.51 
 
 
343 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  29.82 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.28 
 
 
343 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  30 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.66 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.78 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.82 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.15 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.51 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.78 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02281  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.72 
 
 
389 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.37 
 
 
377 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.22 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02191  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.49 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.1 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.24 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.28 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  30.45 
 
 
384 aa  96.3  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  29.79 
 
 
378 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.83 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  28.57 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.57 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  30.07 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  26.67 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.38 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  28.38 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  31.83 
 
 
389 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  27.09 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>