More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0781 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 414 aa  822    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  67.48 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  66.41 
 
 		 390 aa  497  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  66.41 
 
 		 390 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  51.59 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  50.48 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  48.91 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  49.39 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  49.63 
 
 		 412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  39.83 
 
 		 419 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  32.71 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  33.74 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  32.68 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  34.63 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  32.93 
 
 		 418 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  32.56 
 
 		 391 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  38.61 
 
 		 412 aa  170  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  33.93 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  33.97 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  23.08 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  22.92 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  27.92 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  25.47 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  28.44 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  25.59 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  22.53 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  24.55 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  24.67 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  25.1 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  22.25 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.25 
 
 		 1162 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  23.73 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  22.64 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  25.1 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  23.73 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  24.55 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  26.3 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 		 476 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  25 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  24.05 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  23.35 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  22.94 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  26.18 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  25.61 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  23.66 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  27.31 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  23.62 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  24.52 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.45 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.64 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  22.96 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.22 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  24.38 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  24.62 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23.4 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  27.75 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3061  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  27.85 
 
 		 1629 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1021 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.78 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  26.84 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  23.37 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  25.54 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  23.91 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  23.22 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>