More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1278 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  99.23 
 
 
411 aa  788    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  100 
 
 
391 aa  791    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  95.36 
 
 
388 aa  751    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  42.21 
 
 
420 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  43.04 
 
 
410 aa  311  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  42.35 
 
 
419 aa  296  6e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  40.62 
 
 
423 aa  293  5e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  40.2 
 
 
418 aa  281  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  35.71 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  36.02 
 
 
411 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  32.56 
 
 
414 aa  184  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  33.82 
 
 
410 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  38.61 
 
 
415 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  38.61 
 
 
390 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  38.61 
 
 
390 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  29.59 
 
 
413 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  32.15 
 
 
424 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  36.94 
 
 
412 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
425 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  35.71 
 
 
418 aa  139  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  26.96 
 
 
405 aa  106  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  23.68 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  25.81 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.13 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.36 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
470 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  22.97 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  22.97 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  22.97 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  22.97 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  20.79 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  23.96 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  27.31 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  22.97 
 
 
466 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  22.97 
 
 
466 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  24.59 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  22.61 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  21.91 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  23.61 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.31 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  21.91 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  27.01 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  21.91 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  22.79 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  23.93 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  23.61 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  22.71 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  24.74 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  23.96 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  25.45 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  22.22 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  24 
 
 
444 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  24.32 
 
 
508 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  26.92 
 
 
471 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  24.81 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  25.86 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  23.61 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  27.69 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3592  histidine kinase  24.88 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000490069  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  20.43 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  23.26 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  23.29 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  23.61 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  24.4 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  23.29 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  23.66 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  24.03 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479222  normal  0.0168851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  24.13 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  24.43 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  24.8 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  22.58 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  25.12 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  22.58 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  22.58 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  22.58 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  22.58 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  22.58 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  24.37 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  24.37 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  20.13 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  22.96 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  24.37 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  24.37 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  24.37 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>