More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3592 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3592  histidine kinase  100 
 
 
567 aa  1176    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000490069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2158  histidine kinase  37.67 
 
 
536 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  38.22 
 
 
604 aa  154  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  37.78 
 
 
604 aa  153  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  36.32 
 
 
603 aa  150  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  37.22 
 
 
603 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
601 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2914  histidine kinase  32.14 
 
 
520 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.705646  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
473 aa  136  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1892  sensor histidine kinase  35.56 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2181  sensor histidine kinase  35.56 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.547096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
604 aa  133  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  30 
 
 
615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  29.96 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.54 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.62 
 
 
537 aa  127  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  34.23 
 
 
488 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  34.53 
 
 
360 aa  127  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
617 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  31.2 
 
 
609 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
499 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4951  sensory box histidine kinase  29.89 
 
 
617 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  30.09 
 
 
615 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  30.65 
 
 
617 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  30.65 
 
 
617 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  30.65 
 
 
617 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2423  histidine kinase  31.84 
 
 
490 aa  124  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  30.37 
 
 
617 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
589 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.04 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
617 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.04 
 
 
587 aa  122  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
585 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
587 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  29.73 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  28.74 
 
 
620 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
365 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  28.85 
 
 
594 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
584 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  32.43 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
591 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.07 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2750  histidine kinase, putative  31.39 
 
 
495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0186571  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  31.03 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.07 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  31.03 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
597 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3087  histidine kinase  32.6 
 
 
392 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0770082  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
475 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  32.63 
 
 
356 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
446 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
585 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  32.21 
 
 
364 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  32.21 
 
 
364 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
379 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
364 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  27.97 
 
 
616 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  29.78 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
367 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
389 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.92 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1893  histidine kinase  31.3 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00596145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
479 aa  114  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0122916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
453 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31.53 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
389 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
1711 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
464 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>