More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2027 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  98.88 
 
 
445 aa  904    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.53 
 
 
455 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  917    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  66.11 
 
 
418 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
421 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  29.63 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
422 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  33.68 
 
 
423 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  30.37 
 
 
438 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
447 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
436 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
436 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  30.44 
 
 
429 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  29.86 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  29.53 
 
 
426 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
429 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  34.81 
 
 
405 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  31.16 
 
 
421 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
422 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
423 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
435 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
429 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  28 
 
 
420 aa  143  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
430 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  26.03 
 
 
455 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
438 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  32.3 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
444 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  33.68 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  34.52 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
437 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  28.21 
 
 
414 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30.07 
 
 
411 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  30.38 
 
 
429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  29.51 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.87 
 
 
461 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
482 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
478 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  29.82 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
469 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
500 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
500 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  29.11 
 
 
449 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
463 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
400 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
469 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  29.15 
 
 
471 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
465 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
463 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  25.61 
 
 
434 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
467 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
524 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
416 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.87 
 
 
486 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.37 
 
 
463 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
472 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  30.55 
 
 
478 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  24.58 
 
 
469 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  27.04 
 
 
448 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.58 
 
 
370 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
478 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
459 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
489 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  27.18 
 
 
421 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  30.59 
 
 
459 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  28.15 
 
 
467 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
429 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  32.97 
 
 
499 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.1 
 
 
477 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
468 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
455 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  26.77 
 
 
474 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  26.37 
 
 
448 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
421 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
448 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.42 
 
 
471 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  30.33 
 
 
465 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
517 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
474 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
474 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
459 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
489 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
452 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
420 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  30.67 
 
 
506 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  31.75 
 
 
467 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  31.29 
 
 
455 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
515 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
438 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.41 
 
 
468 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
477 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
422 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>