More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0653 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 423 aa  851    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  64.52 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  30.19 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  33.33 
 
 		 418 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  33.7 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 429 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  29.98 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  29.01 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  30.24 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30.6 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  30.57 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  35.25 
 
 		 445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  30.8 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  32.09 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  32.68 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  29.97 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  24.54 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 438 aa  123  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 430 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  31.88 
 
 		 421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  25.64 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  27.5 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  35.24 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  31.18 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 574 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29.51 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.6 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  27.89 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  27.85 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.16 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.16 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  31.67 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  31.67 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  29 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  28.71 
 
 		 592 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  31.67 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  31.67 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  32 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  26.62 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  30.16 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  30.3 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  29.93 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  31.67 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  24.17 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  32.58 
 
 		 584 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  31.33 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  26.95 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  30.73 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  31.92 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  31 
 
 		 586 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 970 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  31.54 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1352 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 569 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  27.35 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.57 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  35.46 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  30.89 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  29.76 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  26.26 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  30.23 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>