More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1866 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  100 
 
 		 421 aa  868    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 422 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  28.64 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  23.8 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  23.99 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  24.29 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 422 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  28.96 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  28.62 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  28.62 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 438 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  23.1 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  23.68 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  28.09 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  22.54 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  28.71 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  24.55 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  27.53 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  27.69 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 437 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  26.12 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  25.65 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  25.8 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  27.45 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  25.36 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 424 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 436 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  27.45 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  24.01 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  26.67 
 
 		 457 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 463 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23.89 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  26.52 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  24.77 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0477  sensor protein BasS/PmrB  26.64 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000367453  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  24.73 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  22.62 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  22.11 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  27.3 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  27.5 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  22.45 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  24.13 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  27.4 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  26.22 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  26.22 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  23.03 
 
 		 592 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  23.91 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0309  sensor protein BasS/PmrB  24.85 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.327284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  28.71 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  26.52 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  25.87 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  25.18 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  25.18 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  26.01 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  25.87 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  23.59 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  25.87 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  23.59 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  23.59 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  23.59 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  21.58 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  23.59 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  26.09 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0979  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.74 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4079  histidine kinase  27.34 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>