More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04467 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  100 
 
 		 420 aa  841    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  33.25 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 455 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30.17 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  27.79 
 
 		 445 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  30.19 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  31.05 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  36.94 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  26.98 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  28.62 
 
 		 449 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  36.49 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  28.37 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  27.38 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  27.38 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  24.92 
 
 		 437 aa  98.2  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 436 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  26.84 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  28.27 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 530 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  28.7 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  28.66 
 
 		 489 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  26.46 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 504 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  25.3 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.77 
 
 		 592 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  26.47 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  24.4 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 477 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  27.5 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  27.68 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  32.47 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  28.24 
 
 		 474 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  28.63 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 970 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  26.52 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  28.47 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  29.74 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  27.02 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  25.83 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  28.48 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 586 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  26.67 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  25 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 644 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  26.03 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 515 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  24.03 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  27.8 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  26.46 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  24.65 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  24.51 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2303 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  23.47 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1033 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>