More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17790 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  100 
 
 
421 aa  851    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.75 
 
 
422 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  57.97 
 
 
434 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  52.97 
 
 
426 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  54.31 
 
 
424 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  53.54 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  53.3 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.61 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.14 
 
 
436 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  52.49 
 
 
426 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.14 
 
 
447 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.66 
 
 
436 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.71 
 
 
437 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  46.99 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  39.95 
 
 
420 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
421 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  31.4 
 
 
423 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  28.64 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
422 aa  162  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  29.05 
 
 
455 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30.03 
 
 
411 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
445 aa  160  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  36.25 
 
 
445 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  30.51 
 
 
418 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  32.07 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  33.13 
 
 
437 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
423 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
444 aa  143  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  28.94 
 
 
438 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
430 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  29.51 
 
 
439 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
449 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  29.4 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
429 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.29 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  28.53 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.22 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  27.45 
 
 
424 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  30.23 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  29.55 
 
 
517 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
504 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  28.83 
 
 
517 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
438 aa  114  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
515 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  29.26 
 
 
526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  27.93 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  28.92 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  28.92 
 
 
817 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
524 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
515 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.33 
 
 
477 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.62 
 
 
461 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  26.3 
 
 
421 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  27.95 
 
 
486 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.04 
 
 
509 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
505 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
496 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
439 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
517 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
505 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
523 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30 
 
 
515 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
505 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
505 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  26.56 
 
 
456 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
470 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
466 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  26.3 
 
 
460 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  29.08 
 
 
452 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  34.52 
 
 
446 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
519 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  29.08 
 
 
452 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
422 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  30.64 
 
 
410 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
474 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  28.95 
 
 
469 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  25.76 
 
 
413 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
480 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  24.8 
 
 
430 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
680 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
471 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  29.08 
 
 
452 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  25.69 
 
 
434 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  28.63 
 
 
428 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  33.63 
 
 
506 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
485 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.29 
 
 
481 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  28.52 
 
 
478 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  28.52 
 
 
478 aa  106  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.57 
 
 
477 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
469 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
517 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
517 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>