More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2374 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  80.63 
 
 		 416 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  100 
 
 		 434 aa  875    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  33.25 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  29.81 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  27.83 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  28.49 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  26.52 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  33.97 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  25 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  27.51 
 
 		 429 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  30 
 
 		 418 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  26.3 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  26.56 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  27.24 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  28.89 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  29.01 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  24.55 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  32.17 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2515  histidine kinase  28.76 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  28.17 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  26.55 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  26.56 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  26.75 
 
 		 410 aa  93.6  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 444 aa  93.2  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  29.79 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  29.92 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  24.82 
 
 		 413 aa  90.5  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  27.27 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  25 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  23.64 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  26.35 
 
 		 467 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  27.74 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  25.45 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  26.07 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  25.5 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  25.17 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  25.46 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  25.9 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  26.19 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  23.58 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  27.21 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  30.93 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  25.09 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  24.53 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.74 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  33.71 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  27.62 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  25.54 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  25.96 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  31.4 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  25.08 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  22.08 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  25.4 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  23.99 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2369  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>