More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2523 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  100 
 
 		 435 aa  901    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  59.9 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  31.27 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30.14 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  28.4 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  28.09 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  25.58 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  25.46 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  28.84 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 424 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  29.21 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  27.31 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  28.87 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  26.86 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  28.1 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  26.71 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  25 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  28.57 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  27.43 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  28.23 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  28.96 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  25.23 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  28.96 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  28.96 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  28.96 
 
 		 363 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  28.96 
 
 		 363 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  28.96 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  25.23 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  28.62 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  28.62 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  25.84 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  29.97 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  26.65 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  29.97 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  29.97 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  29.97 
 
 		 349 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  29.63 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  22.54 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 498 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  23.23 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  22.95 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  28.36 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  25.51 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  31.03 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  28.4 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  25.54 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 515 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  26.36 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  24.55 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  25.39 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.81 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  25.97 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  24.15 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  24 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  25.46 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  26.32 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  28.67 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 513 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 500 aa  93.6  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 517 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  27.36 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  24.04 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 519 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  26.51 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 478 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>