More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0707 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
422 aa  856    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  32.48 
 
 
438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
455 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  31.28 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
436 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  29.64 
 
 
414 aa  172  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
436 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
447 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
436 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  34.52 
 
 
445 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
429 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  30.48 
 
 
429 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
424 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  30.5 
 
 
426 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  29.82 
 
 
426 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
422 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  27.46 
 
 
420 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
423 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  32.3 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  30.33 
 
 
434 aa  141  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  32.06 
 
 
405 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  28.24 
 
 
423 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  30.13 
 
 
437 aa  138  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
444 aa  133  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  24.76 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.7 
 
 
486 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  31.48 
 
 
456 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
1711 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  26.26 
 
 
448 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  26.17 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  27.65 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  29.52 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  27.18 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
691 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
1352 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
438 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
496 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  27.08 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.67 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
473 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  30.43 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
1029 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
455 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
489 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
459 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  30.54 
 
 
389 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.39 
 
 
501 aa  113  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
429 aa  113  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
591 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  31.72 
 
 
398 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.25 
 
 
518 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.87 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  32.19 
 
 
555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  32.35 
 
 
593 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  32.89 
 
 
535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
351 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
500 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
489 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  32.03 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
785 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  32.51 
 
 
428 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
439 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  31.85 
 
 
489 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1383 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  26.35 
 
 
357 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
453 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
350 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
467 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
466 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
476 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.48 
 
 
466 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
482 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  29.96 
 
 
421 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.71 
 
 
490 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  30.87 
 
 
412 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
486 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.22 
 
 
477 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  36.16 
 
 
1202 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
784 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
457 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.17 
 
 
458 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  28.17 
 
 
477 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>