More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0619 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 430 aa  859    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 435 aa  242  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  28.68 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  32.34 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  31.13 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  33.45 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  29.33 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.4 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  28.54 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  29.31 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  25.11 
 
 		 437 aa  113  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  28.37 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  22.22 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  27.1 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  28.05 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  22.62 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.76 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.59 
 
 		 454 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  23.62 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  22.51 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  31.87 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 487 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  28.12 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 439 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.34 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  29.51 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  22.09 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 515 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  32.09 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  32.51 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  27.69 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  30.94 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  27.7 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  28.82 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  31.5 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.1 
 
 		 592 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  28.04 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.13 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  26.17 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  31 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  24.48 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  25.28 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  31.78 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  25.55 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>