More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2660 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
421 aa  870    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  30.25 
 
 
421 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  29 
 
 
426 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  32.71 
 
 
429 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  29.15 
 
 
449 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
422 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
423 aa  116  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
455 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  32.46 
 
 
455 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
421 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  28.93 
 
 
405 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  29.34 
 
 
445 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
445 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  28.34 
 
 
434 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  27.43 
 
 
416 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  28.18 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
422 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  26.39 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  29.46 
 
 
430 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  30.15 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
447 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  31.15 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
436 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  27.97 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
429 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  25.93 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  29.37 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
430 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  26.48 
 
 
425 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  27.64 
 
 
429 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  27.31 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  25.83 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  28.57 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  27.31 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  28.02 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  28.08 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  30.27 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  32.9 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.78 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  29.33 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  26.18 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  26.77 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  25.38 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  27.96 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  25.41 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  25.8 
 
 
460 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  30.17 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  24.42 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  27.21 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  26.87 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  24.84 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  25.08 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
438 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
459 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  27.06 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
449 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  21.91 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  25.08 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  24.38 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  25.57 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  26.6 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  25.94 
 
 
452 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  25.79 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  23.75 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  25.51 
 
 
516 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  24.92 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  25.07 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  27.13 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  25 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  26.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  26.82 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  26.4 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  26.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  26.4 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  26.4 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  26.4 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  24.66 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
463 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>