More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003061 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  71.6 
 
 
426 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  100 
 
 
429 aa  882    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
420 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  35.83 
 
 
449 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
421 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  24.59 
 
 
421 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
421 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
455 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  28.1 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  30.74 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  30.38 
 
 
445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
423 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  29.93 
 
 
405 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  28.42 
 
 
410 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
429 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  25.18 
 
 
423 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  26.46 
 
 
413 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  31.2 
 
 
438 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  25.37 
 
 
413 aa  103  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
422 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  26.62 
 
 
404 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  26.71 
 
 
420 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  23.19 
 
 
430 aa  99.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  24.15 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  26.3 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  24.49 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  28.52 
 
 
455 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  32.12 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  25.89 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  24.27 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
418 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  27.21 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  29.26 
 
 
425 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
437 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  28.78 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
436 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  26.21 
 
 
420 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  25.15 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  26.52 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  24.83 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  25.41 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  32.09 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  25.17 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  26.64 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.25 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  24.93 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  25.85 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  29.7 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  24.86 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23.75 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  24.18 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  24.92 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
469 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  29.12 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  26.55 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  24.14 
 
 
357 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  25.17 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  24.41 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  23.68 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3430  sensor protein QseC  25.24 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  25.32 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  26.96 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  26.11 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  25.1 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  26.14 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  28.4 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  22.76 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  24.22 
 
 
489 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  30.51 
 
 
1140 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.62 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  25.95 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
1140 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>